本期《袁來如此》為系列文章《大分子生物分析概論》的第十三篇,旨在根據(jù)已發(fā)表的文獻資料,對評估藥物臨床前PK/PD時,開發(fā)和選擇LBA方法的策略作初步介紹。
由于內(nèi)容篇幅較長,本文將采取上下篇形式進行推送,敬請垂注!《袁來如此》專欄系廣州博濟醫(yī)藥微信公眾號打造的科普學術專欄,內(nèi)容均為博濟醫(yī)藥子公司深圳博瑞副總經(jīng)理袁智博士原創(chuàng)。
1.導論
藥物發(fā)現(xiàn)是一個快速的transformative的過程,其包括靶標識別、靶標驗證、先導藥物的識別和優(yōu)化。隨著項目推進經(jīng)過這些階段,對生物分析的需求也在相應地改變。開發(fā)合適的生物分析方法可以提供藥代動力學和藥效動力學(PK/PD)的寶貴數(shù)據(jù),以支持在新藥研發(fā)項目不同階段中關鍵的藥效和安全性研究,從而為項目的進展奠定堅實的基礎。在新藥早期的發(fā)現(xiàn)階段,會同時考慮不同藥物模式(drug modalities)的多個分子。一般有多種模式可供選擇,取決于靶標及其位置,例如,傳統(tǒng)的小分子、多肽、單克隆抗體、抗體-藥物偶聯(lián)物、納米抗體、融合蛋白藥物、雙特異性生物藥和寡核苷酸。在生物技術產(chǎn)業(yè)中,藥物的快速發(fā)現(xiàn)以及快速開發(fā)正推動著生物分析領域的發(fā)展和演進。這種演進的主要內(nèi)容是,縮短分析運行時間,實施multiplex分析,提高靈敏度,降低樣品體積的消耗,實現(xiàn)分析測試的自動化。
本文關注的重點是臨床前蛋白藥物生物分析方法的開發(fā)策略,即LBA分析平臺的選擇和方法開發(fā)中的關鍵注意事項。本系列之前的文章,基本是關注用于臨床樣本分析的LBA方法。為了簡單起見,在此文中僅評估用于檢測蛋白藥物的sandwich format的LBA,而蛋白藥物在大多數(shù)情況下,意味著單克隆抗體。雖然相關技術有多方面的進步,本文將重點關注已經(jīng)商業(yè)化和在生物分析行業(yè)十分流行的技術。文末的參考可以引導讀者非常詳細地了解相關內(nèi)容。
目前最流行的3種技術是ELISA、電化學發(fā)光(ECL、MSD、NJ、USA)和Gyrolab®(Gyros Protein Technologies、Uppsala、Sweden)。 同時,本文會簡要地涵蓋以下幾項不經(jīng)常使用但具有超高靈敏度的技術:如基于Single Molecule Array平臺(單分子陣列,Simoa™),單分子計數(shù)[SMC™]的Erenna® 平臺(Singulex Inc、CA、USA),免疫聚合酶鏈反應平臺(immuno-polymerase chain reaction、immuno-PCR、 Imperacer®、Chimera Biotec GmbH、Dortmund、Germany)。另外,還會簡要介紹multiplexing的Luminex平臺(Luminex xMAPR、Luminex Corporation、TX、USA)。在藥物發(fā)現(xiàn)階段,分析方法開發(fā)是生物分析的主要內(nèi)容之一,同時,應當特別考慮評估耐受性(tolerance)和分子完整性(molecular integrity)。
2.臨床前LBA方法的關鍵參數(shù)
用于藥物發(fā)現(xiàn)階段的生物分析方法有5個重要參數(shù):樣品體積要求,定量的動態(tài)范圍,測試運行時間,靈敏度和自動化程度。本文將簡要地評估這些參數(shù),并介紹這些參數(shù)在選擇檢測平臺時發(fā)揮的重要作用。
1) 樣本體積消耗
從小鼠身上單次采集的血清或血漿樣本的體積約為50ml。隨著在動物研究中嘗試實施3R(替換replacement,減少reduction 和細化refinement ),生物分析業(yè)界正在探索多種微體積采樣方法,而這將進一步大幅度地減少樣本體積。另外,在分析小鼠腦脊液等基質(zhì)的樣本時,只有2-5ml的體積可用??紤]到有可能意外損失樣本,故從動物獲得的樣本體積應足以分析樣本至少兩次。因此,應當首選能夠使用低樣本體積的分析技術和平臺。
2) 定量動態(tài)范圍
能夠在寬廣的動態(tài)范圍內(nèi),至少包含3-4個數(shù)量級,進行定量分析是極其有益的。對于PK分析,這允許較高的最小稀釋要求(minimum required dilution,MRD),以盡量減少樣本基質(zhì)效應,同時為低劑量給藥的樣本提供所需的定量靈敏度。同樣,對于PD,它允許在更寬廣的范圍內(nèi)測試平行性(parallelism),從而允許對含有高濃度生物標志物的樣品進行大幅度的稀釋。對于生物標志物測量,稀釋還有助于最大限度地減少樣本和基于緩沖液的標準曲線(替代基質(zhì))之間的基質(zhì)差異,從而更精確地生成定量數(shù)據(jù)。
3) 分析運行時間
分析運行時間是實施PK/PD樣本分析所需時間,假定使用之前已為該應用開發(fā)分析方法,這也意味著假定試劑已標記,緩沖液已制備,并且相關儀器也已準備就緒。在non-GLP臨床前生物分析實驗室中,時間是至關重要的;在大多數(shù)情況下,最終目標是提供可靠,且可以重現(xiàn)的數(shù)據(jù),同時保持較短的分析運行時間。這就提高了實驗室的效率,并允許該部門同時支持多個項目。分析96樣本微孔板的運行時間可以在1-5小時的范圍之間,具體取決于采用的分析技術(對于某些分析技術,有額外的隔夜捕獲步驟overnight capture step)。
4) 靈敏度
大多數(shù)傳統(tǒng)的單克隆抗體的PK定量LLOQ在幾個ng/ml范圍。一些高效力藥物分子(需要低劑量)和低豐度(或下調(diào)了的)的生物標志物可能需要更高的靈敏度。應當依據(jù)個案的情況為這些應用選擇相應的分析平臺。此外,高靈敏度的分析方法是高度依賴所使用的試劑,因此獲得高特異性和高親和力的試劑可以大大提高定量的靈敏度。提升分析靈敏度也同時降低了對樣本體積的要求,見1)。
5) 自動化
自動化平臺可縮短分析人員操作的時間,提高生物分析部門的效率。在臨床前藥物開發(fā)的環(huán)境中,分析平臺的完全自動化,在需要開發(fā)分析方法且進行常規(guī)樣本分析的情況下是非常有益的。同時,對于方法開發(fā),優(yōu)化和因基質(zhì)或物種變化而進行的方法認證,需要能夠修改自動化平臺上的檢測方法的靈活性。
除了分析測試自動化之外,還可以自動化地制備標準品(standards)和質(zhì)量控制樣品(QCs),從而節(jié)省時間,降低珍貴參照(比)物料(reference material)的使用和成本,并減少手動移液產(chǎn)生的誤差。一些分析測試平臺,如Gyrolab,允許檢測的全自動化,而Hamilton和HPD300這樣的平臺,則可以允許自動化移液體,或制備標準品和QCs。超高靈敏度的Simoa™平臺也支持自動化地樣本檢測。
3.臨床前LBA免疫測試平臺
目前,有多種LBA測試平臺在新藥開發(fā)中得到應用。表1列出了若干LBA測試平臺及其比較。本文將進一步介紹其中幾種在生物分析行業(yè)中應用比較廣泛的平臺。由于為臨床前研究開發(fā)分析方法所選擇的LBA平臺,很可能會繼續(xù)在臨床研究中繼續(xù)使用,因此,選擇合適的測試平臺,將會是影響深遠的一個重大決定。
表1. 若干LBA測試平臺相關特征的比較
備注:上表中的方法未全部在文中詳細介紹。
近年來,一系列immunoassay的新技術,特別是基于微(磁)珠(beads,magnetic,etc.)的技術,從測試格式的物理學/物理化學層次,待測物的捕獲,檢測信號的收集/放大,數(shù)據(jù)處理等方面,實現(xiàn)了顯著改善,并取得了相當?shù)纳虡I(yè)性成功,雖然這些新方法在化學和生物學層次,仍然是基于抗體-抗原的結(jié)合作用以及基本的夾心式immunoassay。本文選擇若干得到廣泛商業(yè)應用的測試平臺,及其在臨床前生物分析方法開發(fā)的應用作初步介紹,希望起到拋磚引玉的目的,引發(fā)更多關于新的分析測試技術的開發(fā)和應用的相關討論、交流和研究。
ELISA平臺
ELISA是生物制藥行業(yè)內(nèi)外使用最廣泛的配體結(jié)合式(LBA)檢測平臺。ELISA的測試格式包括直接式、間接式和夾心式;ELISA經(jīng)常用作與開發(fā)中的新分析平臺進行比較的基礎;在96孔板上,通常對樣本進行復孔(duplicate)測定,手動或半自動運行。通常使用比色法的檢測試劑,但有時也使用其他檢測試劑,如發(fā)光(luminescence)和熒光(fluorescence)。通常,對ELISA方法,需要監(jiān)測試劑,如抗體(antibodies)、配體(ligands)、緩沖液(buffers)以及批次的變化。
幾十年來,傳統(tǒng)的ELISA一直是蛋白質(zhì)定量分析最常用的技術,因此也是最可靠的技術之一。即使在今天,大多數(shù)生物標志物的商業(yè)檢測試劑盒都是基于ELISA的。多數(shù)新分析技術都與作為金標準的ELISA比較。但是,這種分析技術也有缺點,例如,測試運行時間約長為 4-5 小時,樣品體積消耗大(測定體積為100 ml),靈敏度低與LLOQ在大多數(shù)情況下接近低-中ng/ml,以及狹窄定量動態(tài)范圍(2-3 數(shù)量級)。這項技術對于某些臨床前生物分析的應用仍然很有吸引力,比如血清單克隆抗體的PK。該平臺還提供了在方法開發(fā)早期階段評估測試方法不同部分的靈活性。表2列出了不同檢測平臺的性能,以一個mAb藥物為例。
表2. 與ELISA比色法檢測相比較,一個mAb在若干檢測平臺上LBA方法參數(shù)的比較
備注:上表中的方法未全部在文中詳細介紹。
電化學發(fā)光(Electrochemiluminescence,MSD)平臺
MSD平臺是一種基于微孔板的測試格式,它利用電化學發(fā)光(ECL)信號進行檢測。在這個平臺上,免疫測試格式類似于用于藥物定量和target sample measurements的典型ELISA格式,但預計靈敏度會因使用化學發(fā)光而增加。MSD平臺似乎主要在檢測信號的產(chǎn)生和收集上,相對于ELISA有顯著改善:MSD采用SULFO-TAG(三聯(lián)吡啶釕)是一種發(fā)光底物,其分子量約為1000Da(大約是HRP的1/40),因此空間位阻小,易于標記抗體,且不易妨礙其與待測物或其它抗體的結(jié)合。SULFO-TAG在陽極表面失去電子,發(fā)生氧化,在三丙胺陽離子自由基的催化及三角形脈沖電壓激發(fā)下,可產(chǎn)生高效、穩(wěn)定、連續(xù)的電化學發(fā)光信號,使得檢測信號增強并穩(wěn)定(見圖1)。
圖1. MSD的電化學發(fā)光產(chǎn)生的檢測信號
MSD的電化學發(fā)光技術在生物分析行業(yè)廣受歡迎。它保持了ELISA格式的優(yōu)點,如方法開發(fā)的靈活性,另外在其它領域也非常出色,如較小的樣品體積要求(測定體積為25–30 ml),更高的靈敏度(低-中pg/ml)和寬泛的動態(tài)范圍(4-5個數(shù)量級)。當以均相的測試格式運行時,此平臺可能受到鉤效應(hook effect)的影響。鉤效應起源于不合適的抗體-抗原濃度比例,但是可以減輕甚至消除的。此外,試劑和微孔板容易有批次間的變化,因此,強烈建議在批次之間進行交叉比較。
MSD微孔板的孔底為石墨底,捕獲抗體包被載量可提升10-50倍,檢測范圍比ELISA擴展了10-100倍,定量動態(tài)范圍高達5-6個數(shù)量級,靈敏度可提升10-1000倍(fg/ml-pg/ml級別)。根據(jù)對血清免疫學中的“帶現(xiàn)象”的理解,可推測:包被抗體載量可以根據(jù)檢測靈敏度的需要進行調(diào)整,以避免鉤效應(hook effect)。分析運行時間接近約3-4小時,但考慮到該平臺提供的其它優(yōu)勢,測試時間可被視為一個合理的折中。該平臺允許同時運行多個96孔板,因此在分析數(shù)百個樣品時,測試一個或多個96孔板也只需要基本相同的時間,這一點可能非常有利。此平臺不是自動化的,因為它需要分析人員參與每個步驟。此外,該平臺還提供與實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)的集成和US FDA 21 CFR part 11的合規(guī)性,允許分析方法結(jié)果容易地轉(zhuǎn)移到GLP的環(huán)境中。
Gyrolab平臺
Gyrolab是一個非96微孔板的免疫測試平臺,具有液體處理功能(liquid handling capability),使用小體積的樣本和試劑在光盤(CD)上實施免疫測定。該測試格式使用biotinylated捕獲試劑和標記有fluorophore的檢測試劑,在納升體積的使用親和力微珠填料的捕獲柱(nanoliter volume affinity capture column)上進行測試。利用CD的微觀結(jié)構確定樣品和試劑的體積,并通過旋轉(zhuǎn)CD將樣本加到捕獲柱上。在每個CD上,有96(在1000nlCD上)-112(在20或200nl CD上)個微觀結(jié)構,可產(chǎn)生96-112個數(shù)據(jù)點(1小時/CD運行時間)。在Gyrolab工作站上,樣品處理完全自動化,液體處理臂將樣品和試劑從微孔板轉(zhuǎn)移到CD,并通過激光/檢測器測定每個捕獲柱的熒光信號。基礎的Gyrolab xPlore™ 允許無人值守地一次分析1張CD,而Gyrolab xPand™允許分析多達5張CD(即480-560個數(shù)據(jù)點)。在大多數(shù)情況下,動態(tài)范圍為3-4個數(shù)量級。該平臺的靈敏度可與MSD的ECL平臺(低-中pg/ml)相媲美。
Gyrolab是一個自動化的微流體系統(tǒng)(microfluidic system),且其離心操作能夠高效地處理微量體積,因此大多數(shù)重復(duplicate)分析只需要小于5ml的樣本體積,就可以從同一微孔板重新分析未使用的樣品。該平臺使用包被了捕獲抗體的微珠來捕獲待測物,與下面討論的Luminex和Simoa平臺在捕獲待測物的原理上,即在更大的固相表面積上有更多的捕獲抗體(與ELISA相比),似乎有異曲同工之妙,總體效果是提升了捕獲待測物的效率,提升了靈敏度。Gyrolab的一個出色特點是,可以選擇不同的CD來調(diào)整定量的動態(tài)范圍,以滿足對低或高濃度樣本的分析。該分析技術平臺對于大分子的常規(guī)臨床前PK/PD分析無疑是非常有效的。此平臺在縮短檢測時間方面非常有效,無需人工移液和參與分析的每一步驟。這使得該平臺對開發(fā)方法和分析樣本都極具吸引力。此外,該平臺還提供實驗室信息管理系統(tǒng)集成和FDA 21 CFR part 11合規(guī)性,能夠?qū)⒎治龇椒ㄝp松地轉(zhuǎn)移到GLP環(huán)境中去。
Gyros的一個可能缺點是,如果以基于微孔板格式開發(fā)了分析方法檢測,則相同的試劑在轉(zhuǎn)移到Gyros時可能會性能欠佳,并且可能需要顯著地優(yōu)化才能獲得最佳性能。這是因為Gyros的孵育時間極短,需要高結(jié)合效率的捕獲試劑,而基于微孔板的檢測則不需要這種試劑,因為較長的孵育時間抵消了該需求。因此,如果使用Gyros,則需要在同一平臺對試劑進行篩選,然后測試其分析性能,并開發(fā)完整的分析方法。
BIAcore平臺
基于BIAcore平臺的藥物分析,依賴于待測物與固定在傳感器芯片(sensor chip surface)表面的待測物特異的試劑的相互作用。BIAcore實時監(jiān)測該結(jié)合相互作用,并讀出以相對響應單元(relative response units,RU)為單位的響應,該響應與Surface Plasmon Resonance(SPR)角度的變化相關,并且由傳感器芯片表面的液體薄膜的折射率變化所決定。折射率的變化與芯片表面結(jié)合的質(zhì)量成正比。這種實時的無標記技術與典型的免疫測定法有很大的不同,免疫測定法需要多個孵育和洗滌步驟,以及用于信號讀出的標記檢測抗體(labeled detection antibody)。對于臨床前藥物分析,可以將抗藥物特異性抗體固定在芯片表面實施通用化檢測,當樣本流經(jīng)分析隔室(cell)時,該抗體將結(jié)合樣本中所含有的mAb藥物。其它方式,如在芯片上固定待測物,也可用于特定的定量分析。對于此平臺,在驗證期間必須經(jīng)過10個周期的殘留(carry-over)測試,并且還應確定最大信號值(相對于背景值)的信號噪聲比(signal-to-noise ratio),以評估樣本分析期間的方法運行性能。此外,還必須評估在執(zhí)行大批量樣本分析的較長時期內(nèi)的芯片穩(wěn)定性(分析方法是特定于所使用的芯片類型)。由于該平臺通常運行一夜或更長時間,故樣本和試劑的穩(wěn)定性必須比典型的免疫測試方法具有更長的短期穩(wěn)定性(超過24小時),而且在Biacore T200上,樣本的總通量(overall sample throughput)較低。此外,單個分析運行需要包含校準曲線后和運行序列中間隔的QC樣本。通常,這對應于一個微孔板的校準品(calibration standards,Cs)和樣本。
可以對BIAcore實施IQ/OQ/PQ驗證,以滿足符合21 CFR Part 11的要求。使BIAcore儀器達到GLP合規(guī)的狀態(tài)不是一個簡單的過程,需要投入大量時間來處理數(shù)據(jù)傳輸(data transfer)和合適的校準(隨時間推移的)等問題。
該測試平臺更多地用于LBA關鍵試劑的篩選和表征。LBA關鍵試劑一般定義為:對待測物(analyte)特異性的LBA分析試劑,如抗體、多肽、蛋白質(zhì)、耦合物(標記),作為試劑的藥物和ADA試劑(陽性和陰性對照品)。
多通道(multiplexing)分析技術
Multiplexing測試方法可以節(jié)省時間和寶貴的樣品。但是,存在一個局限:即它們經(jīng)過嚴格優(yōu)化,只能在指定范圍和基質(zhì)中使用。不同的待測物對不同的基質(zhì)和稀釋的反應不同,因此,對于某個待測物,優(yōu)化參數(shù)的偏差可能需要重新優(yōu)化整個multiplexing檢測方法。在臨床前生物分析中,需要探索了解多種藥物、多個藥物變異體、多種藥物的組合和多種生物標志物。因此,檢測的靈活性是非常關鍵的,對此multiplexing可能幫助意義不是很大。
在樣本體積十分有限的特殊情況下,可以探索multiplexing。允許自主開發(fā)multiplexing方法的平臺包括:Luminex的xMAP技術,使用獨特的dyed beads,并取決于所使用的儀器(MAGPIX、LUMINEX 200或FLEXMAP 3D),可以分析50-500待測物;Quanterix SR-X,使用6個獨特的磁珠,可以multiplexing多達6個待測物;Quanterix SP-X可以multiplexing到10個待測物,使用其基于平面陣列的空間分離的化學發(fā)光成像技術。其中,MSD允許從黃金標準的singleplex平臺直接轉(zhuǎn)換到U-PLEX平臺進行檢測;Quanterix的SR-X和SP-X平臺在multiplexing時能夠提供超高靈敏度。
Luminex平臺
常用的Luminex®100/200™系統(tǒng)是基于流式細胞學(flow cytometry)原理的靈活程度很高的分析儀。該系統(tǒng)使用很小的樣本體積,在單個微孔板的孔/井中multiplex(同時測定)多達100個待測物。該平臺可以操作許多檢測格式,包括核酸測試方法(nucleic acid assays)、受體-配體測試方法(receptor-ligand assays)、免疫測試方法(immunoassays)和酶測試方法(enzymatic assays),并提供快速且經(jīng)濟高效的生物測試結(jié)果。
該系統(tǒng)是xMAP® 3個核心檢測技術的組合。第1個是xMAP微球,這是一個熒光染色,微米大小的聚苯乙烯微球系列,既作為標識符,又充當建立測試方法的固體表面。第2個是基于流式細胞學的儀器(flow cytometry-based instrument),Luminex 100/200分析儀集成了關鍵的xMAP檢測組件,如激光、光學器件、流體技術和高速數(shù)字信號處理器。第3個組件是xPONENT®軟件,它專門設計為基于方案(protocol-based)的數(shù)據(jù)采集方式,具有強大的數(shù)據(jù)回歸分析的能力。
Luminex利用特定染料的珠子(beads),該珠子包被有特定的抗待測物抗體。添加待測物孵育后,再添加熒光標記的抗體,以檢測和定量待測物。此項技術使用供應商預先生產(chǎn)的試劑盒,主要用于PD檢測,即生物標志物的定量分析,并且采用多通路檢測(multiplexing)的方式。商業(yè)化的試劑盒數(shù)量巨大,據(jù)稱達1,300余種。一個樣本可以用于測定多個待測物,據(jù)稱最多可達500個,并且可以對每種待測物設置接受標準。不足之處是:不同待測物珠子(analyte beads)有交互干擾(cross-talk)的傾向,而且測試方法對光敏感,因此必須采取特殊的預防措施。
超高靈敏的定量分析技術
對于某些藥物和樣本基質(zhì),可能需要具有fg/ml-低pg/ml的超高靈敏度的定量分析方法。相關狀況包括定量低豐度的生物標志物,對強效藥物分子的PK分析和定量極易受到基質(zhì)效應影響的待測物,顯然,大幅度稀釋樣本會提升對測定平臺靈敏度和定量動態(tài)范圍的要求。
目前,允許自主開發(fā)方法的超高靈敏度的定量分析平臺包括來自Quanterix,基于Simoa™的數(shù)字化ELISA,來自Singulex的使用單分子計數(shù)(single molecule counting)的Erenna™,以及來自Chimera Biotec GmbH的基于免疫PCR(immuno-PCR)的Imperacer。
之前已經(jīng)發(fā)表的文章詳細評估了這3種超高靈敏度的分析技術,以及其它不太流行的分析技術。這3種技術都是需要供應商提供檢測方法的分析儀器,但都允許用戶自主開發(fā)檢測方法。當擁有實時定量PCR(qPCR)儀器(thermal cycler fitted with a fluorimeter)時,還可以獨立于供應商提供的試劑或儀器開發(fā)Immuno-PCR方法。在使用這些技術時,需要特別注意一些非常規(guī)情況,包括Simoa™ 的磁珠偶合,DNA與檢測試劑的偶合,以及無污染地操作immuno-PCR。
基于單分子陣列(Simoa™)的數(shù)字化ELISA
來自Quanterix公司的Simoa™數(shù)字化ELISA是一個很有前途的平臺,它可以使蛋白質(zhì)定量達到fg/ml。該技術采用基于微觀順磁珠(microscopic paramagnetic bead)的免疫測試方法,并結(jié)合獨特的信號檢測和數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)。數(shù)字化ELISA分2個階段實施。在捕獲抗原的第1階段,涂有捕獲試劑的微觀磁珠與樣品混合,然后加入生物素標記的檢測抗體(biotinlabeled detection antibody)和鏈球菌素-β-半乳糖酶(streptavidin–b-galactosidase)。然后,這些珠子被加載到光盤上,光盤上裝有一系列體積為飛升(femtoliter)大小的微井陣列。每個微井的直徑為4.5mm,能夠容納直徑為2.7mm的珠子數(shù)目只能為1或者為0。被硅膠墊片密封的微井含有熒光底物,其用于信號生成和放大(圖2)。Simoa™ 技術在定量分析的第二階段采用了獨特的信號檢測系統(tǒng)。微井(50飛升)中濃度相對較高的發(fā)出熒光的產(chǎn)物(陽性事件)和白光散射(white light scattering)測定的總珠子負載可以由標準的CCD攝像機輕松地檢測到和記錄。通過改進幾個檢測步驟,Simoa™ 實現(xiàn)了超高靈敏度。
圖2. 在飛升體積(femtoliter)的井陣列中裝載,密封和成像單個順磁珠
因為在100mL的反應體積中有約200,000個磁珠,而每個磁珠捕獲約80,000個抗體分子,抗體-待測蛋白的比值和平衡允許高效地在給定的示例中,>70%捕獲待測物。由于溶液中有這么多的磁珠,而且可以在溶液中運動,所以捕獲效率進一步提高,因為每個目標蛋白在不到1分鐘時間內(nèi)就會遇到磁珠。這與傳統(tǒng)的LBA方法中,固定在一個表面的捕獲抗體與待測物的緩慢結(jié)合完全相反。另外,優(yōu)化了的biotin-labeled detection antibody與streptavidin–b-galactosidase之間的比值,可減少檢測背景并最大化特定信號的采集。與Simoa™檢測系統(tǒng)相結(jié)合,相關熒光信號可以通過熒光底物(fluorogenic substrate)的酶消化(enzymatic digestion),而進一步放大。
Simoa™ 檢測系統(tǒng)能夠檢測到單個結(jié)合事件(a single binding event),該事件可以在低濃度下以數(shù)字方式獲得(靈敏度增高,數(shù)字化ELISA),或在高濃度模式下以模擬的方式獲得(擴展了的定量動態(tài)范圍)。熒光用于檢測酶活性,并能夠測定每個磁珠上酶的平均值。與下面描述的Erenna®平臺一樣,結(jié)合數(shù)字式和模擬式的讀數(shù)功能,可以實現(xiàn)非常寬廣的定量動態(tài)范圍。由于最終信號采集是在平面陣列上完成標準成像,因此與使用 Erenna®等流體系統(tǒng)的數(shù)值讀出相比,數(shù)據(jù)采集更快。
盡管Erenna® 和Simoa™ 平臺具有數(shù)字讀出和寬廣的定量動態(tài)范圍等共同點,但Simoa™ 平臺是一個完全自動化的系統(tǒng),該儀器可以實施樣品稀釋(高達1:10稀釋),混合,洗滌,孵化和數(shù)據(jù)采集步驟。Simoa™ 能夠同時測定多達10種不同的待測物(multiplexing)。這是通過對單個捕獲抗體使用不同的dye linkers來實現(xiàn)的。之后,對陣列進行多個波長的熒光成像,以識別擁有不同dye linkers的亞組,并確定是否存在enzyme reporter標記。與Singulex和Quanterix一樣,有許多試劑盒可供選擇。也可以“定制”開發(fā),或“自主開發(fā)”分析方法。
憑借較高的靈敏度、multiplexing和自動化功能,該平臺看起來非常理想。Simoa™平臺與LIMS系統(tǒng)兼容,其軟件滿足監(jiān)管級別的生物分析據(jù)FDA 21 CFR part 11的合規(guī)性要求。筆者認為該平臺因其超高靈敏度(可以使用微量樣本體積)和自動化操作,在相當?shù)某潭壬峡梢蕴娲鶪yrolab平臺,用于臨床前PK樣本分析。
Singulex Erenna®平臺
Erenna®免疫測試系統(tǒng)利用兩步的過程實現(xiàn)超高靈敏度定量分析(ultrasensitive assays)。最初,使用biotinylated capture試劑和熒光標記檢測試劑,在96孔板中實施基于珠子(beads)的夾心式測試格式。從珠子上洗脫的被捕獲待測物被轉(zhuǎn)移到一個384孔的讀取板(reading plate),然后將該讀取板放置到檢測儀器上。然后樣本一個接一個地通過毛細管進入flow cell,并在其中實施激光誘導的單分子檢測分析。該平臺的優(yōu)勢是寬廣的定量動態(tài)范圍,其通過獨特的軟件曲線擬合算法實現(xiàn)。該算法利用了多次讀數(shù),提升了靈敏度。
與其它測試平臺相比,檢測時間較長,但一些線下的自動化設備可用于洗滌和轉(zhuǎn)移步驟。該平臺通常用于PD檢測,但也可用于PK定量分析。對供應商生產(chǎn)和供應的試劑盒,其穩(wěn)定性必須由最終用戶評估,因為試劑的穩(wěn)定性通常是未知的。此外,可以購買通用試劑,以開發(fā)內(nèi)部的檢測試劑,而且,基于微孔板的格式也能兼容使用96或384孔板的平臺。供應商建議對校準品(Cs)進行3次復測(triplicate),以便在低濃度下進行精確分析??梢酝ㄟ^IQ/OQ程序,與內(nèi)部PQ相結(jié)合,驗證Erenna®平臺。如果將Erenna®與LIMS結(jié)合,以實施監(jiān)管級生物分析,則一個選擇是使用讀出的三個信號之一進行濃度分析。但是,動態(tài)范圍和靈敏度可能會受到影響,具體取決于選擇哪個讀出的信號。
Immuno-PCR (Polymerase Chain Reaction)
Immuno-PCR(Chimera)是一種擴增免疫測試技術(signal amplification immunoassay)。它涉及DNA標記的檢測抗體的擴增,從而提高靈敏度。與ELISA中使用的抗體-酶偶合物(antibody–enzyme conjugates)不同,IPCR中的關鍵試劑是抗體-DNA偶合物(antibody–DNA conjugates),其中一個DNA標記(marker)與檢測抗體相偶合。然后,將DNA polymerase加入到反應主混合物之中,就可以放大檢測信號,并通過定量PCR(qPCR)而定量測定DNA-marker的濃度,從而定量分析analyte–antibody immunocomplex。因此,該技術主要改進了檢測信號的放大方法。但是,如果檢測抗體與血清或血漿中的成分發(fā)生交叉反應,該平臺可能容易受到強大基質(zhì)效應的影響。因此,在方法驗證期間必須評估信噪比,并用于確定樣本分析期間方法的性能。
該平臺的優(yōu)點包括寬廣的定量動態(tài)范圍和提升了的靈敏度,這對PD分析是很有益的。與 Erenna®平臺一樣,檢測試劑高度依賴于供應商,對于大批量樣本分析來說,成本可能很高。如同MSD、Erenna®和其它基于珠子的平臺一樣,應特別注意標記試劑和微孔板批次的變化。由于該平臺依賴于PCR技術,因此在處理樣本、試劑和移液器槍頭時必須小心謹慎,以避免污染。此外,數(shù)據(jù)分析可能也會較為麻煩(cumbersome)。
7. 特別聲明
本文如有疏漏和誤讀相關指南和數(shù)據(jù)的地方,請讀者評論和指正。所有引用的原始信息和資料均來自已經(jīng)發(fā)表學術期刊, 官方網(wǎng)絡報道等公開渠道, 不涉及任何保密信息。 參考文獻的選擇考慮到多樣化但也不可能完備。歡迎讀者提供有價值的文獻及其評估。
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